秦始皇說：呂不韋於我有恩，本可不死，可是我有1000個殺他的理由

前247年莊襄王去世，嬴政十三歲繼位，呂不韋以仲父身份繼續執掌相國大權。嬴政親政前，呂不韋主導一切，朝政軍務皆出自他手。這段過渡期看似平穩，實際嬴政從小目睹呂不韋的強勢，積累不滿。呂不韋主張無為而治，君主只需制定職責，讓臣子憑才幹辦事，強調威嚴不可過度依賴嚴刑，否則民眾反叛。他在《呂氏春秋》中詳述這些，試圖讓秦國從純法家轉向更平衡的治理。

嬴政不同，他一心統一天下，信奉法家鐵腕，事必躬親，重用獄吏推行酷刑。兩人政見分歧從嬴政親政開始顯現，前236年討論蜀地管制時，呂不韋建議緩和，嬴政堅持嚴法。這不是小事，關乎秦國未來方向。呂不韋的寬政雖吸納人才，但被嬴政視為軟弱，妨礙統一大業。嬴政親政後，第一件事就是收回權力，他巡視軍營，發現軍官仍尊呂不韋舊令，警覺加深。呂不韋十二年相國，親信布滿六卿和軍中，昌平君等舊部掌兵符，這讓嬴政覺得王權受威脅。

政見碰撞不止理念，呂不韋的門客體系成了導火索。前237年，秦王政十年，嬴政下逐客令，表面針對外來人才，實際指向呂不韋的養士三千。茅焦勸諫後，嬴政收回成命，但矛頭已明。呂不韋的權力太大，嬴政必須清理，以免舊勢力阻擋改革。呂不韋雖有恩於秦室，但嬴政視之為過去式，新政需要新班底。李斯等呂門客轉投嬴政，證明呂不韋的網絡雖廣，卻擋不住君王鐵腕。